手足口病疫苗一般都是EV71型肠道病毒灭活疫苗，可以预防由EV71感染引起的任何程度手足口病，保护率达到97.3%。预防重症手足口病的保护率同其他疫苗一样，接种本疫苗的人群不一定能产生百分之百的保护效果，同时该疫苗不能预防其他肠道病毒感染所致的手足口病。少数人接种后没有产生抗体或者仍然发病，由于疫苗本身的特性和接种者的个体差异有关系。接种对象为六个月到五岁的儿童，基础免疫为两剂次，接种间隔为一个月
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