肠系膜血栓的死亡率在临床上没有进行过系统的数据学统计，但总体的死亡率还是非常高，尤其是一些大面积的肠系膜上静脉血栓，另外肠系膜静脉血栓的死亡率还与患者有没有进行积极治疗有关。如果病情比较轻没有特别明显的临床症状，经过积极的溶栓治疗多数不会导致死亡，有一部分患者会出现腹部胀痛不适但是没有及时治疗，血栓范围比较大引起了大范围的肠管坏死，即便是手术预后也通常会比较差一些，甚至引起短肠综合征。所以当怀疑有肠系膜血栓时一定要及时到正规医院就诊。
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