支原体肺炎主要是由于支原体感染引起的肺部呼吸道黏膜的炎症反应。
首选的治疗药物是大环内酯类药物，比如红霉素、罗红霉素、甲红霉素、阿奇霉素、美满霉素、克拉霉素等。
如果患者出现对大环内酯类药物耐药，不敏感时，还可以选择四环素类药物，比如强力霉素、米诺环素、美他环素等。
还可以选择喹诺酮类药物，比如左氧氟沙星、氟罗沙星、美洛沙星、加替沙星等。
必要时可以取呼吸道的分泌物作病原体培养，以及药物敏感实验，选择高度敏感的抗支原体的药物，调整治疗方案。
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