老年人患有糖尿病、心脑血管疾病、血液疾病等全身疾病的比例较高，因此用药多而复杂，这些情况对于牙周手术存在一定影响，需要排除全身疾病等禁忌症，方能进行牙周手术，以免发生出血、感染或者危害全身健康，甚至危害生命的危险。
而且牙周炎本身的严重程度也会影响后续牙周手术的效果，如牙周支持组织破坏过多的患牙，可能导致术后牙齿松动加重，得不到预期的治疗效果，因此对于手术指征的把握尤为重要。
对于不能保留的牙齿须尽早拔除，不能为了强行保留而进行手术治疗。另外，局部炎症刺激因素未消除时，因疾病导致不能进行良好的菌斑控制，以及大量吸烟等因素，均可影响牙周手术的效果。这些刺激因素都是牙周手术的风险，确定进行牙周手术前，需要进行全面的风险因素评估。
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