药物难治性癫痫者常伴有癫痫共患病，严重影响患者的生活质量，导致失眠、头疼、认知功能障碍，包括学习能力下降、记忆力减退、抑郁、性格改变，严重者出现自残、攻击倾向。迷走神经刺激术能够改善患者认知障碍、稳定情绪，同时是治疗难治性抑郁的有效方法。对于灾难性癫痫患儿，迷走神经刺激可显著改善学习、运动、语言功能。
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