大多数疗程为4-6周。对于自身免疫性脑炎，因为现在医学水平提高，大家认识水平也得到了提高，所以越来越多的可能会达到诊断目的。在之前医疗水平不是很好，没有很多诊断手段时，往往可能会将一些自身免疫性脑炎诊断为其它类型脑炎。自身免疫性脑炎根据病人情况不一样，可能治疗时间、疗程上会有一定区别。一般都是根据患者情况进行治疗，和其它免疫相关性疾病治疗一样，多数需要4-6周的治疗，再根据情况来决定后续患者需不需要采取长期小剂量免疫抑制、免疫调整药物治疗。
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