先天性房间隔缺损并不是遗传性疾病，不会遗传给下一代。房间隔缺损，是因为胚胎在发育过程中出现异常，导致房间隔未发育完全，出现左向右分流的先天性心脏病变，在母体怀孕四个月时通过做心脏彩超可以发现。发病原因主要和母体怀孕初期有关，可能是母体在怀孕前三个月有病毒感染史，如流感病毒、风疹病毒等；也可能与环境因素有关，如怀孕初期接受放射性物质如X线，有毒、有害物质，母体缺乏营养等。大约5%的先天性心脏病患者发现有染色体病变，也有发现房间隔缺损有家族史，但这并不是遗传性疾病。
