肾结石手术其本身的手术并发症有出血、感染、损伤等。但是肾结石手术有它的特殊并发症，比如结石残留、结石复发、切口感染、肾盂局部感染等。出血主要是肾脏肾实质本身出血，损伤主要是输尿管或者肾盂的其他的结构损伤，其有自身的特殊性，医生如果操作熟练的情况下这些并发症都应该是可以避免的。但是有极少数情况下可能会出现较严重的并发症，比如输尿管撕脱、肾脏大出血或者结石通道的感染，这种情况的发生率都是较低的，肾结石手术本身还是较安全的。
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