未分化脊柱关节病的病因目前不是很清楚。但是脊柱关节病总体来说和慢性感染有一定关系，尤其是肠道感染，甚至慢性咽炎感染。它和类风湿关节炎一样，也有一定的遗传背景，尤其是HLA-B27阳性，这类的患者更容易得未分化脊柱关节病，但是也未必，有些病人HLA-B27阴性也得脊柱关节病。所以它有一定的遗传背景，同时再加上外界环境，比如菌群紊乱、食品，即病人食物、肠道菌群调查来看，脊柱关节病更容易有小肠细菌过度生长，即外界环境更容易影响这类患者。所以目前来看，还是遗传背景到外界环境的影响。环境影响不仅仅是肠道微生态，可能和皮肤，包括呼吸道微生态都是有关系，这也是近几年力图要做的，要明确的。肠道微生态和转录组学、代谢组学有什么关系，怎么造成的未分化脊柱关节病，认识未分化脊柱关节病，也许对所有的风湿病都是大的突破，其实所有的风湿病或多或少都有骶髂关节的改变，或多或少都是从脊柱关节病开始的，包括痛风在内。所以这是个较大的课题，但是经过几年努力，能逐步阐明它到底是什么原因造成的。
