单心室患儿术后的存活率和死亡率与手术方式、医院水平、患儿一般情况均有相关性。
其中姑息式手术也就是将腔静脉与肺动脉进行吻合的手术，虽然近期效果明显，但十年死亡率仍在30%到75%之间；心室排外手术虽然是经典的术式，但是手术的相关死亡率也在14%到25%之间；心室分隔手术虽然从解剖上隔离了体循环与肺循环，但是早期和晚期的死亡率仍然高达47%和18%。
单心室手术成功后基本不影响远期预后，超过20岁基本也能超过50岁。
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