单纯疱疹的治疗原则为缩短病程，防止继发细菌感染和全身播散，减少复发和传播机会。
内服药物治疗主要是抗病毒药物和免疫调节药物。
常用的核苷类似物有阿昔洛韦，伐昔洛韦，泛昔洛韦，对核苷类药物耐药时可使用磷甲酸钠。
免疫调节药物，包括转移因子，左旋咪唑，白介素，免疫球蛋白，干扰素，胸腺肽等，有预防和减少复发的作用。
初发型单纯疱疹，可以服用泛昔洛韦750mg/d，分3次口服，疗程5-7天。
频发型的单纯疱疹，1年复发6次以上，为减少复发次数，可以应用病毒抑制剂治疗，即阿昔洛韦600mg/d，分3次口服，或伐昔洛韦500mg/d口服，一般需连续服用6-12个月。
外用药物可以选用喷昔洛韦软膏，炉甘石洗剂等。
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