具有传染性的角膜炎大多是细菌或者病毒感染，如果条件允许，可以做一个菌培养和药敏实验，针对性的选择药物治疗。
例如细菌性的结膜炎，可以用氧氟沙星，妥布霉素等滴眼液局部点眼，病毒性的角膜炎临床也主要以抗病毒，例如更昔洛韦眼用凝胶。
同时也可以经常冲洗结膜囊以及使用促进角膜修复的滴眼液，例如贝复舒滴眼液。
在治疗期间要预防传染，主要是左右眼和他人交叉感染，注意手部卫生。
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