肠镜检查主要包括两方面，检查功能和治疗功能。检查功能是病人如果出现腹痛、腹泻、大便习惯、性状改变，甚至便血症状后，此时结肠镜检查指征非常强。病人有肿瘤家族史，一般四岁左右时虽没症状，可选择结肠镜检查。高度怀疑结肠肿瘤时，或有部分肠梗阻表现，怀疑肠道有器质性疾病时，需结肠镜检查。慢性结肠炎或结肠术后改变，需定期复查，也需结肠镜检查。
治疗功能为肠镜下可做息肉内镜切除或下尿道出血，包括血管畸形、憩室出血的止血治疗。如果肠道狭窄，可植入支架缓解症状。
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