根除幽门螺杆菌后建议停药4周后再复查，从而才能避免假阴性的结果。临床上使用四联疗法治疗幽门螺杆菌，包括两种抗生素、质子泵抑制剂、铋剂。而在用药过程中可以将绝大多数细菌杀灭，但有时细菌并没有真正的完全死亡，只是活性下降，所以在短期内复查幽门螺杆菌有可能出现假阴性结果。当停药4周后，在去除可疑因素的情况下，如果细菌仍然存在，此时进行尿素呼气试验则能够检出。
呼气试验能够较为准确地检查有无幽门螺杆菌感染，并不推荐使用抽血查抗体的方法，因为即使目前已经不存在幽门螺杆菌感染，但抗体还会在体内存在很长一段时间，所以停药后抽血查抗体仍然会出现阳性情况，对诊疗的判断毫无意义。综上所述，如果进行幽门螺杆菌治疗，建议停药4周以上复查，复查方法首选尿素呼气试验。
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