胃食管反流症的并发症常见的有上消化道出血、食管狭窄、巴雷特食管。胃食管反流病是指胃、十二指肠内容物反流入食管引起烧心等症状，可引起反流性食管炎，以及咽喉、气道等食管邻近组织的损伤。
胃食管反流症因为食管黏膜糜烂以及溃疡，可以导致上消化道出血，临床表现可有呕血或者黑便，以及不同程度的缺铁性贫血。此外，食管炎反复发作，导致了局部的纤维组织增生，最后导致食管的瘢痕狭窄，出现了食管狭窄。
巴雷特食管内镜下的表现为正常，呈现均匀粉红带灰白的食管黏膜，出现胃黏膜的橘红色，分布可为环形、舌形或岛状。巴雷特食管可以发生在反流性食管炎的基础上，巴雷特食管是食管腺癌的癌前病变，其腺癌的发生率较正常人高许多，也是胃食管反流症的一类比较严重的并发症。
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