如果确定膀胱输尿管反流的严重性和临床症状需要手术治疗， 可以考虑以下几种常见的手术。 手术的原则大都是一样的，即建立一段粘膜下的输尿管通道， 让输尿管膀胱接口的解剖恢复正常的解剖。当膀胱充盈后， 尿液挤压这段粘膜下的输尿管， 暂时关闭输尿管的内腔，起到反流的作用。
各手术的效果和成功率相若，为95％-99％。手术的 选择视乎医生的经验。 医生采用个人经验多的术式，病发症的几率自然少些。
术式分类:
膀胱内(intravesical) 输尿管再植. 打开膀胱后，横断输尿管，然后游离一段输尿管， 建立一个黏膜下通道， 将输尿管放置在黏膜下， 输尿管出口在通道的出口重新吻合。输尿管出口是用原出口的方法为Politano-Leadbetter 氏手术，用新出口的为Cohen 氏手术(经三角区，cross-trigonal ), 或 Glen-Anderson 氏手术 (新出口接近尿道内口)。手术需要切开膀胱， 有一个新的吻合。
这些方法，特别是Cohen氏手术，在国内，香港，英国和澳洲(前英联邦国家)流行。这类手术最担心的并发症输尿管吻合口狭窄和游离后的输尿管扭转或曲折。由于切开了膀胱，术后需要插尿管，会有几天的血尿。 术后2-3天可以出院。
膀胱外手术
(extravesical), 又名Lich-Gregoir 氏手术。 手术切开一段逼尿肌，用其包埋一段输尿管， 也同样的建立了一段黏膜下输尿管的抗返流机制。好处是不必切开膀胱，也不必重新吻合输尿管。 破坏性较小。 这术式在美国和一些欧洲国家较流行。 由于没有切开膀胱，没有切断输尿管，这就避免了输尿管的扭曲和狭窄。 一般孩子1-2天后可以出院。因为切开了逼尿肌，术后一小部分孩子(特别是做了双侧手术的)，膀胱功能恢复的慢些，需要尿管2-3天。
微创手术：
以上两种方法传统的方法是经下腹的一个横切口进入的开放性手术。香港中文大学的教授杨重光创立了个用腹腔镜的微创Cohen氏手术方法，即气膀胱技术 (pneumovesicum)。我2006-08年间在中大工作时，跟他学了不少。 Lich-Gregoir 氏手术现在也可以用腹腔镜做。
目前一些西方国家，特别是美国，用机器人(达芬奇)辅助腹腔镜做这些手术开始流行， 做的最多的是 Lich-Gregoir 氏手术。 我们也开始用机器人做Lich-Gregoir氏手术，我个人觉得在盆腔里缝合，机器人还是有精准的优势。微创的伤口小一些，恢复的应快些。当然对于一个新的技术，每个人，由于个人经历不同，都会有不同的看法，这是很自然的。只有经过时间的考验才能做出最终的判断。
低度的反流， 在国外也可以考虑通过膀胱镜输尿管出口黏膜下注射一种填充物质，成功率略低，53％-87％。 最流行的是一种商品名为Deflux的填充物，目前国内没有。这治疗的 方法的优势是没用伤口，孩子可以当天出院。2-5年后的复发率为13％(Lackgren 2001)。
