腰穿脑脊液检查痛苦很小，腰穿时需做局麻，因此患者通常无明显疼痛感，局麻后给予腰椎脑脊液穿刺。腰椎脑脊液穿刺成功，留取脑脊液以后，患者需要去枕平卧六小时。
有部分腰穿后的患者可能出现低颅压、头痛症状，这是常见的并发症之一，患者在腰穿24小时后，有少数患者会出现头痛，站立位或者咳嗽时症状加重，平卧时症状减轻。此时应鼓励患者大量饮水，必要时可静脉输入生理盐水，数天后低颅压、头痛症状可自然缓解。
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