肺泡蛋白沉积症的自愈时间因人而异，有1/3的患者可以自行缓解，但是仍然可以复发。约1/3的患者因呼吸衰竭并发感染死亡，具体缓解的时间差异很大。
肺泡蛋白沉积症是以肺泡腔内聚集大量的表面活性物质为特征的疾病，好发于青中年，男性多于女性，病因未明。可能与免疫功能有关系，或者是与粉尘有关。尤其是接触矽尘的动物可引起PAP，故认为可能是对某些刺激物的非特异性反应。临床上的症状是起病隐袭，无特征性。常见的症状是活动后气促、咳嗽、咳少量白色黏痰，可伴有低热、乏力、胸痛，而且咳血者少见，1/5患者可出现杵状指，患者预后差异很大。
由于一般药物治疗效果不佳，目前全肺灌洗是最有效的治疗手段。近年来发现有部分患者对抗粒细胞、巨噬细胞、集落刺激因子治疗有效，应积极进行治疗。
