引起丛集性头痛的原因有以下几个方面：第一、有些患者跟遗传因素有一定的关系，少部分的患者有家族史。第二、丛集性的头痛，和睡眠觉醒周期有一定的关系，有些患者他头痛有固定的时间，每天在夜间或者入睡以后1-2个小时出现头痛，还有些患者有周年的周期性，比如有些患者于每年的一个时期出现丛集性头痛的发作。饮酒、强烈的气味的刺激，比如油漆味、香水味等刺激以后，也可以引起丛集性头痛的发作。还有药物如硝酸甘油，还有抗抑郁的药物，应激以及身体的创伤等也可以引起丛集性头痛的发作。
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