由于肿瘤细胞和正常细胞间缺少根本性的代谢差异，而且化疗药物属于全身用药，因此所有的抗癌药物都不能完全避免对正常组织的损害。
抗癌药物的不良反应大多发生于增殖旺盛的组织，如骨髓，胃肠道，毛囊等，可以出现：1.骨髓抑制：导致白细胞，血红蛋白以及血小板的减少。
2.胃肠道反应：大多数化疗药物都可引起恶心，呕吐等胃肠道反应，尤其多见于含铂类的化疗方案。
3.脱发。
另外，还有局部刺激，过敏反应，肝肾心脏等损害。
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