比较严重的食管炎，由于长期的慢性炎症可以导致食管的瘢痕形成狭窄，最后导致患者的吞咽困难，还有一严重的食管炎患者可以因为食管黏膜的糜烂导致出血，长期慢性的少量失血或者偶尔也有患者可以出现大出血，最后导致贫血。其他还有食管外的症状，例如胃食管反流，可以通过环咽肌进入咽喉导致气管的误吸，导致诱发患者产生哮喘。比较重的食管炎产生溃疡之后导致血管的破裂，也可以发生呕血，少数的非常严重的穿透性溃疡可以发生食管的穿孔。
