艾滋病晚期时由于患者免疫功能丧失，对各种感染和恶性肿瘤的防御能力下降，可以引起多脏器的并发症以及恶性肿瘤，所以晚期除了持续性的发热以及消瘦以外，还可以出现多系统的临床症状，主要有以下几种：
1、呼吸系统症状：如长期的咳嗽、胸痛、呼吸困难，严重时痰中带血。
2、消化系统症状：如食欲下降、厌食、恶心、呕吐、腹泻，严重时可以便血，通常应用于治疗消化道感染的药物也对此类腹泻无效。
3、神经系统症状：如头痛、头晕、反应迟钝、智力减退、精神异常、抽搐、偏瘫、痴呆等。
4、皮肤黏膜损害：如单纯疱疹、带状疱疹，还有口腔与咽部黏膜的炎症、溃烂，以及体表的卡波西肉瘤，可见红色与紫红色的斑疹、丘疹和浸润性肿块。
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