药物流产是通过口服孕激素受体拮抗剂终止妊娠。孕激素是怀孕必要激素，也是保胎激素。如果用抗孕激素药物流产，主要会导致胚胎在子宫里得不到孕激素的营养和支持作用，其就容易发育不良，容易流产。患者吃2天孕激素受体拮抗剂以后，还会吃前列腺素样的物质。前列腺素可导致子宫收缩。前期在孕激素受体拮抗剂的影响下，胚胎已经较脆弱，后期如果再加上前列腺素药物引起宫缩，其就容易被排出体外。
但是每个人对药物的敏感性不同，部分人群吃这些药物对胚胎的作用并不大，或者其引起的宫缩也不好、胚胎排不出，所以会失败。其和做手术不同，手术只要医生操作到位，用暴力、机械的方法能刮下。药物流产后有10%-15%的病人会排不出胚胎，或者只排出一部分，绒毛部分排出，蜕膜部分没有排出，最后还需要刮宫。如果胎囊完全在宫腔里，同样需要再清宫才能排出，所以药流的成功比例在85%左右。
