上吐下泻往往是急性胃肠炎，如果还未去医院就医，可以服用黄连素，或者枫蓼肠胃康等药物来进行自行治疗，如果服用这些药物效果欠佳，应该及时去医院进行诊治。到医院往往会进行血常规、CRP、PCT的检查，还要进行大便的常规及潜血以及大便分析，来了解是感染性的腹泻还是非感染性腹泻。
如果是细菌性感染，服用抗生素效果非常好，而且上吐下泻的情况很快就能止住。如果是非感染性腹泻或者病毒感染所致，无需抗病毒或抗生素治疗，主要是对症处理。临床上要注意，上吐下泻的时候胃肠负担较重，饮食宜清淡，太过严重，就要禁食、禁水，进行静脉营养支持治疗。最严重的一种上吐下泻疾病是霍乱，霍乱有烈性传染性，一定要注意呕吐物、排泄物的隔离，防止交叉感染。
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