晚期血吸虫病，疾病难以恢复，预后一般是比较差的。
反复大量的血吸虫感染，如果不能得到及时正确的抗病原治疗，虫卵对于门静脉系统的损伤是比较严重的，病情会逐渐的发展为肝硬化，可以出现门静脉高压、脾脏增大等临床表现。
临床主要有四种类型，首先最为常见的就是巨脾型，脾脏进行性的增大，同时伴有脾功能亢进，患者容易出现消化道出血、腹水等并发症。
第二种是腹水型，是严重肝硬化的重要标志，患者腹部极度的膨隆，腹壁静脉怒张，可以因为消化道出血、肝性脑病、感染或者肝衰竭而死亡。
第三种是结肠肉芽肿型，以结肠病变为突出表现，最后导致肠功能衰竭或者诱发癌变，而危及到生命。
第四种为侏儒型，比较少见。
晚期血吸虫病患者虽然经过治疗，大多预后不良，死亡率非常的高。
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