尿路结石形成的原因包括身体代谢异常、尿路梗阻感染、饮食习惯和生活方式、药物使用等。
身体代谢异常：形成尿结石的物质排出增加，由于尿液中钙、草酸、尿酸或胱氨酸排出量增加，容易形成结石。如长期卧床、甲状旁腺功能亢进者尿钙增加；痛风病人尿酸排出增多；胱氨酸排出量增加常见于家族性胱氨酸尿症病人。
尿路梗阻感染：尿路梗阻、感染和尿路存在异物均是诱发结石形成的局部因素，梗阻可以导致感染和结石形成，结石会加重梗阻与感染的程度。
饮食习惯和生活方式等：喝水少使得尿量减少，尿中盐类和有机物质的浓度升高。不爱运动易造成尿液沉积而形成结石。爱吃草酸含量高的食物。饮食上爱吃菠菜、豆类、可可、茶叶等，这都是富含草酸的食物，容易患草酸性结石。摄入嘌呤过多。各种动物内脏、海鲜、花生等均含有较多的嘌呤成分，多吃易产生尿酸性结石。
药物使用：药物可以引起肾结石。一类药物为尿液浓度高而溶解度比较低，如氨苯喋啶和磺胺类药物；一类药物为能够诱发结石形成的药物，如乙酰唑胺和皮质激素。
尿结石形成原因多样，应针对病因进行预防。多饮水、少吃含草酸和嘌呤丰富的食物均有助于预防。
