断肢再植术后的并发症有很多，如术后肝肾功能衰竭、脂肪栓塞、大出血、低蛋白血症、电解质的紊乱及伤口的感染、骨折不愈合、骨不连，肌腱粘连，神经肌肉的萎缩等一系列并发症。但前期最主要的并发症是因为吻合血管后大量肌肉组织坏死、崩解后，引起的急性肾功能衰竭。如出现较大的并发症，危及全身、危及生命需要立即行肢体解脱术，术后如果感染予以加强换药有效的抗生素治疗，骨不连术后待肢体稳定后行植骨手术等治疗，肌腱的粘连术后予以督促患者行手部功能的锻炼。如3-6个月无法缓解，可行肌腱粘连松解术，神经的损伤可以术后行高压氧，口服营养神经药，尽可能让神经得以恢复。
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