食管胃黏膜异位先天性的很少，多数是后天性的化生，即Barrett食管，癌变率平均为13.6%，是食管下段腺癌的最主要来源。食管胃黏膜异位发生癌变率比普通食管炎癌变率较高，因此建议患者一定要定期检查身体，若发现病变取病变组织活检做病理检查，从而明确诊断，以免延误病情。食管胃黏膜异位通常是食管中下段可出现皮脂腺，异位的胃黏膜小岛多位于食管上段，取代局部食管鳞状上皮或位于上皮下，可有糜烂或溃疡形成。建议患者一定要定期复查、密切随诊，防止发生癌变。
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