临床上首先没有慢性结肠炎这样的诊断，如果肠道的慢性炎症性的疾病，就是炎症性的肠病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病，溃疡性结肠炎主要是累及结肠，克罗恩病是累及整个消化道。
这类疾病患者在活动期应有充分的休息，调节好情绪，避免心理压力过大。急性活动期可给予流质或半流饮食，病情好转后改为富营养易消化的少渣饮食，调味不易过于辛辣，注意饮食卫生，避免肠道感染性疾病，不易长期饮酒。按医嘱服药及定期医疗、随访，不要擅自停药，反复病情活动者应有终身服药的心理准备。
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