器质性发音障碍多由先天性疾病导致，出生后即出现，可伴有先天性喉喘鸣或呼吸困难，还有腭裂，兔唇患儿也会出现发音障碍。此外，用声不当所致发音障碍最为常见，常因发音或歌唱时由于方法不当，或过度用声所致。
引起器质性发音障碍的主要疾病：
声带小结：见于儿童及成年女性。多由于长期发音滥用后声带组织损伤所致。其它因素包括心理因素(患者多具有进攻性人格)。过敏。内分泌失调。呼吸道感染。烟雾刺激。声带脱水。听力障碍。慢性咳嗽及咽喉部反流等。
声带息肉：病变位于声带固有层浅层、位于声带游离缘中1/3，多为单侧，有或无蒂、水肿或血管瘤样。常常为发音滥用后引起，可能与过度用声后血管脆性过度增加有关。
声带囊肿：为声带内的囊肿，多见于成人。由腺管阻塞、粘液潴留引起，随时间增大。对侧可出现小结(kissingnodules)。
喉接触性肉芽肿：损伤可为机械性和/或炎性，有些原因不明者命名为特异性。
声带沟：为平行于声带边缘的纵向的沟样凹陷。
