新型冠状病毒肺炎中期的主要临床症状是发热、呼吸困难、干咳。新型冠状病毒肺炎虽然是以呼吸系统症状为主，但是在疾病的进程当中，也可能会伴随着多种神经系统的症状，部分患者甚至以神经系统的症状为首发症状，有少数患者会出现眼部的眼结膜炎的症状。
在病程当中，患者会出现多种多样的消化系统症状，有时也以消化系统症状为首发症状。消化系统症状主要可以见于厌食、恶心、呕吐、腹痛、腹泻、肝酶异常，严重者可以出现消化道出血，其中以腹泻最为多见，腹泻的次数、持续的时间以及严重程度报道不一。有文献报道，腹泻可以作为预测重症患者的独立危险因素之一。
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