脑血栓形成急性期有效的治疗方法包括静脉溶栓、支架取栓、抗血小板药物、他汀类药物、改善循环药物、脑保护药物、抗凝治疗、降纤治疗、防治并发症的治疗、脱水降颅压治疗，甚至进行手术解除颅内压增高的治疗。
如果是发病4.5小时之内没有禁忌症，尽量选择静脉溶栓或支架取栓的方式，这种情况可以最大限度和可能达到血管再通，以减少神经缺损，防止遗留后遗症，如果是发病的4.5-6小时，一般选择进行支架取栓，发病在6-24小时之内可以在影像学指导下进行支架取栓治疗，如果发病超过24小时，最有效的治疗方法是进行抗血小板和他汀类的治疗，可以应用的药物是阿司匹林、氯吡格雷以及阿托伐他汀、瑞舒伐他汀，同时有些方法也可以帮助治疗脑血栓形成，比如抗凝治疗肝素或者新型抗凝药物泰毕全，还有利伐沙班等，同时可以应用巴曲酶等进行降纤治疗，中药类的改善循环药物也是有效的，比如银杏叶制剂、三七总皂苷以及葛根素类的药物等等。
如果病人并发了急性的脑水肿，还要给予积极的脱水降颅压治疗，防止发生脑疝，如果内科治疗效果不好，还可以应用去骨瓣减压术或小脑减压术的方式来减轻脑水肿，而且急性期要注意脑血栓形成常见并发症的防治，包括卧床之后的坠积吸入性肺炎、应激性溃疡、消化道出血、离子和内环境的紊乱、褥疮等。
