儿童核磁共振检查头部一般没有副作用，磁共振是利用原子在磁场中发生共振而重建的一种成像技术。因为属于无害的影像学检查方法，小儿可以做磁共振检查，多没有任何年龄限制。如果孩子能配合，幼儿也可以做。
但要注意一点，安装心脏起搏器的病人也没有办法做磁共振检查。磁共振检查在小儿神经内科和小儿神经外科使用比较广泛，所有脑部疾病病人，包括癫痫病人必须要做此检查。它没有辐射，所以对孩子发育一般没有影响，对孩子大脑也没有影响。孩子做磁共振也要提醒家长，因为磁共振检查设备时间比较长，而且需要患者静状态下去做，儿童可能因为哭闹等原因不配合，需要给儿童解释清楚。
