直肠术后大便恢复正常，大致需要半年到一年左右时间，因直肠切除后直肠壶腹被切除，大便没有储存部位，会导致大便次数增多、排便频繁、排便不尽感。因直肠切除术后吻合口处出现水肿、瘢痕，会引起患者大便频繁、黏液便。
部分手术患者由于直肠神经受损，出现肛门括约肌功能失调，影响肛门收缩功能，导致大便失禁，而吻合口水肿和瘢痕的消除需要三个月到半年时间，因此患者术后半年左右能逐渐恢复排便规律，大约术后一年时间排便功能逐渐恢复正常。建议患者术后常做肛门提肛运动、肛门区温水坐浴、理疗、按摩，都可促进患者术区肠道功能恢复。
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