便秘的原因有很多，按病因分为功能性便秘、器质性便秘、药物导致的便秘。功能性便秘最常见的是慢性功能性便秘、肠易激综合征，主要是因为肠道动力障碍或排便障碍导致的便秘。器质性便秘见于多种器质性疾病，与便秘有关的器质性疾病，包括肠道本身疾病，比如结直肠肿瘤、炎症、结核、结肠扭转。
全身性疾病，包括糖尿病、甲亢、甲减、电解质紊乱，比如低钾或者高钙，一些神经系统疾病，如自主神经病变、帕金森病，肌肉疾病如全身性系统性病变、淀粉样变、系统性硬化。与便秘有关的药物也很多，像抗胆碱药常用来解痉止痛，抗组胺药常用于抗过敏，还有钙离子拮抗剂、铁剂、钙片、非甾体抗炎药等，可能会在某些人身上诱发便秘。所以如果出现便秘，特别是近期出现，应该到医院检查，确定病因以后再进行相应的处理。
