一般绝大多数肺炎链球菌菌株对青霉素比较敏感，所以一般应用青霉素可以迅速治愈，如果是对青霉素过敏的婴幼儿，可以考虑静脉注射红霉素治疗，病情好转后可以改口服治疗，治疗疗程要持续1-2周，或者是完全退热后。如果青霉素用药后2-3天病情没有见到好转，应该考虑偶见的抗青霉素菌株而改用其他的抗菌药物，可以根据咽拭子培养出的肺炎链球菌敏感试验结果，而改用其他药物。由于小儿肺炎常常不能在24小时内做出特异性病原诊断，婴儿可以使用广谱抗生素来治疗不明致病菌的肺炎。近年来多应用一代和二代头孢菌素来进行治疗。
