奥美拉唑为质子泵抑制剂，服用时间至少4-6周，有时延长到8周，可根据溃疡的大小、形态决定。多发性溃疡，即十二指肠可能有多个溃疡，有的病人是胃和十二指肠都有溃疡，为复合性溃疡。而幽门螺杆菌感染是十二指肠溃疡最常见的病因，几乎90%左右有幽门螺杆菌感染。
在服用奥美拉唑的同时，要将幽门螺杆菌根除，同时加2种抗生素，加1种胶体铋剂，进行4联疗法，通常疗程为2周。但奥美拉唑服用时间应为4-6周，甚至8周，即2个月，溃疡才能够完美愈合，形成瘢痕。否则愈合疗程不够，愈合的溃疡形态不规则，形成十二指肠腔狭窄，有的形成瘢痕粘连、梗阻，对后续疾病恢复不利。此外，需注意幽门螺杆菌根除后，停用奥美拉唑2周才能复查。
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