胃窦属于胃体和幽门的之间部分，处于胃的下部，广义的胃窦则包含幽门在内，向上和胃体相连，向下通过幽门和十二指肠连接。这个位置因为幽门定期开放，胃窦相对于胃体内径明显缩小容易造成食物拥堵，食物滞留时间比较长容易造成胃黏膜的损伤，属于胃炎、胃溃疡等疾病的好发部位。如果有慢性腹痛，尤其是伴有腹胀、腹痛，需要考虑到胃窦病变的可能，通常需要做碳14吹气试验、胃镜等检查判断原因。如果存在幽门螺旋杆菌感染，需要及时用做幽门螺旋杆菌根治治疗，已经形成胃窦炎可以用奥美拉唑、果胶铋等药物治疗。
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