吃完饭肚子咕咕叫的症状初步诊断是功能性消化不良所引起，患者发生功能性消化不良后会打破消化道菌群的平衡，并造成功能障碍的现象。肠胃内的食物无法被及时分解、转化会与多种有害菌群发生发酵反应，生成大量气体物质。另外由于肠胃蠕动频率减缓、排空功能受阻，气体物质会在局部淤积造成肠胃内部空间扩张、肠胃液流动加剧，从而导致腹部异响。但是也不排除患者有肠易激综合征、慢性肠胃炎、幽门螺杆菌感染等其它病症的可能性，因为以上疾病类型对于患者消化道正常功能运行会造成严重影响，从而造成此类不良症状的发生。
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