细菌性咳嗽通常不会自愈。细菌性咳嗽多是因为细菌感染呼吸道而引起的临床症状，例如形成细菌性的感冒，细菌性的支气管炎、支气管肺炎、肺炎。部分患者还可以因慢阻肺或支气管扩张继发细菌感染，而诱发患者咳嗽程度加重。对于此类细菌性咳嗽的患者，多需要早期予以相应的抗生素抗感染治疗。根据其痰培养、血培养、血常规，以及胸部X线或CT检查的特点，选用其敏感的抗生素抗感染治疗，通常还需要配合止咳、祛痰、退热等对症处理。细菌性咳嗽一旦发生不能等待其自愈，因为如果未及时予以相应的抗生素抗感治疗，其细菌感染的程度可以加重，还可以导致细菌由上呼吸道向下呼吸道蔓延，由支气管炎变为肺炎，使疾病变的更加严重。故对于细菌性咳嗽患者一定要予以早期的抗感染治疗。
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