纤支镜主要针对肺部的疾病，比如通过影像学的相关检查，包括双肺的X光片、CT甚至核磁共振等，无法明确肺部的占位性病变的性质，包括多种感染因素和恶性病变、良性的肿瘤的检查。比如由于感染结核分枝杆菌引起的支气管内膜结核，以及占位性病变，可疑的支气管肺癌、肺泡细胞癌以及尘肺、矽肺等，通过纤支镜的检查做出诊断。可取活组织做病理检查，明确病因，及时的对症和病因治疗。
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