食管炎治疗原则主要是控制胃食管反流消除症状。药物主要选择抑酸剂，抑酸剂是治疗反流症状的主要药物。在抑酸药物中质子泵抑制剂效果要优于H2受体拮抗剂，但是目前尚没有确凿的证据说明质子泵抑制剂能逆转柱状上皮化生或者预防腺癌的发生，使用质子泵抑制剂，要按照胃食管反流常规治疗，足疗程应用。质子泵抑制剂效果不佳的原因大多是用药剂量不当或用药方法不当。有些患者可合用用质子泵抑制剂和H2受体拮抗剂。另外应用促动力药物和黏膜保护剂。如果疼痛比较明显的患者还可以应用镇痛药。另外如果反流性食管炎，合并了Barrett食管，可以选用内镜下治疗。
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