小脑炎的诊断事实上在临床医学中并不是规范诊断。小脑炎诊断和治疗应该在颅内感染的框架之内，如果影像学检查等提示明确感染部位在小脑、脑膜以及实质，可将其称为小脑炎。在此基础上可以进一步地进行病因学确定，最基本的是做腰穿脑脊液的病原学检查，同时做自身免疫抗体检查，针对病因给予相应治疗。
在对因治疗的基础上，患者也存在明显的头晕、恶心、呕吐、行走不能等表现，所以也可给予对症治疗，比如苯海拉明等止吐、止晕治疗。需要强调的是如果病变处在小脑部位，就要注意在后颅窝的病变，再加上脑膜脑脊液的分泌增多、脑脊液压力增高、脑实质肿胀等原因会引起颅内压升高，尤其脑疝形成的风险会较其它部位升高。因此，可根据颅内压力等情况给予降颅压治疗，避免出现呼吸、心跳骤停、脑疝等严重情况。
