如果房颤没有采用复律治疗，需要长期服用药物。房颤服用的药物主要是控制心室率的药物，常用的有为β受体拮抗剂、钙通道阻滞剂、洋地黄类药物以及抗心律失常药，如胺碘酮等。有些患者房颤发作时心率不快，也可以不给予控制心室率的药物。由于房颤容易在左心房内壁形成附壁血栓，血栓脱落引起外周动脉栓塞，尤其会引起脑栓塞的发生，因此房颤的患者，还需要长期口服抗凝药物进行抗凝治疗，可以选用华法林或者新型的抗凝药。如果使用华法林进行抗凝治疗，需要定期监测国际标准化比值，使国际标准化比值控制在2-3之间。
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