不同部位、不同手术方式对术后复发率影响很大。比如肢体更容易达到完整切除，肢体软骨肉瘤复发概率非常低。位于骨盆、脊柱软骨肉瘤，由于解剖结构限制，完整切除困难较肢体大，但近几年在骨盆、脊柱肿瘤的治疗方面也有很大进步，比如脊椎软骨肉瘤可以做全脊椎切除，虽然手术难度非常大，手术时间也很长。以往脊柱软骨肉瘤如果采用病灶内手术，患者几乎100%复发，采用全脊椎甚至全骶骨的手术方式，可以达到很好的局部控制率，局部复发概率跟肢体非常接近。
软骨肉瘤是起源于软骨的恶性肿瘤，对放化疗都不敏感，手术是唯一可以治愈软骨肉瘤的治疗方式，因此，对于软骨肉瘤尽量在肿瘤外正常组织内完整切除肿瘤。即使发现长了骨肉瘤也不用担心，早期发现的骨肉瘤治疗效果较好，综合治疗后70%以上的儿童既能保住命，也能保住肢体，且功能较好。
