进行脑穿刺可能会引发感染或者大出血的风险，因为这种治疗主要是通过颅脑部位局部穿刺降低颅内压，从而缓解临床上的一系列症状。但是如果患者本身患有感染性疾病，或者长期患有糖尿病等其他疾病，在穿刺之后会导致颅内出血，脑室逐渐扩大，也会产生脑室系统灌注。
如果存在手术室消毒不彻底的情况，就会出现感染，会引起脑部出现突然性的炎症反应，不仅会引起中枢性的高热，同样也会影响到生命安全。除此之外，这种手术有一定的风险，进行穿刺之后很可能会因为触碰到动脉血管，从而引起出血。如果患者本身患有动脉瘤，会引起动脉瘤破裂，也会导致大出血。
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