卡介苗反应主要临床症状可以包括有发热39.5℃，甚至39.5℃以上，从而引起卡介苗全身性反应。这种发热一般可以持续12小时，甚至超过12个小时，而一部分孩子可以表现为低中度热，体温在38.5℃或者是38.5℃以上，持续48小时或者是超过48小时。
卡介苗反应，首先，会有肺炎、肝炎、外泌尿生殖器官功能异常，以及在活体组织检查的时候能够发现肉芽肿性炎症。其次，有败血症的表现，包括循环系统不良、急性呼吸困难，以及弥散性血管内凝血。然后，个别孩子接种卡介苗之后也可以引起局部的反应，如果灌注之后膀胱受药物刺激，可以出现尿频、尿急、排尿困难、血尿等等。
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