由于脑卒中是一个致残性疾病，会引起肢体功能障碍，如偏瘫、共济失调、动作不协调。也有患者偏身麻木，在麻木基础上，影响精细动作，都属于卒中后运动功能障碍。
对于运动功能障碍，治疗上以治疗脑梗死为主。急性期可用治疗急性脑梗的阿司匹林、氯吡格雷或者他汀类药物，加营养脑细胞药物缓解急性期症状。如果患者有急性大面积梗塞，出现水肿，可能涉及脱水剂治疗。
对于经过一定时间治疗瘫痪有所改善，但是还没有完全恢复到正常者，甚至肌力经过治疗之后完全恢复正常，但是运动功能还不能够达到发病前水平者，涉及康复训练，称之为脑梗塞后遗症，也属于运动功能障碍范畴。这时可能要加入辅助设施，如平衡能力缺失，需要平衡木训练，步态不稳涉及步行器或康复师进行平衡功能锻炼。
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