室间隔缺损的处理，在临床当中也是多样化的。在医疗中心可以看到室间隔缺损通过介入方式，用封堵器将室缺进行封堵，这类微创手术方式可以完成部分室缺的处理。外科最常用的室间隔缺损的处理方式，是用补片修补。因为室间隔缺损位于心脏内部，所以，在手术开始的时候，必须先通过动脉静脉插管，建立体外循环通路。当体外循环机器全速运转之后，会把心脏停跳，根据室缺的不同部位，采取右心房切口或者肺动脉切口进入心脏，直视下用自体心包补片，完成室缺的修补过程。修复室缺的材料也不尽相同，最早的时候，采用Dacron补片。包括其它中心也有用Gore-tex补片，或者用牛心包补片，还有自体心包补片，通过戊二醛固定以后，修补在室缺部位，通过一圈的连续缝合关闭室缺。
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