根据痣细胞在皮肤组织学上分布不同，色素痣分为皮内痣、交界痣、混合痣三种类型：
①皮内痣是指痣细胞只存在于真皮下方。外观常常高出皮肤，呈半球形;最为稳定，一般不恶变;
②交界痣是指痣细胞存在于表皮与真皮交界处，一般来说是平平的，稍稍高出皮肤;交界痣最为活跃，最容易恶变。通常认为长在手掌、手指甲、脚底、脚趾、脚趾甲、眼睑结膜、口唇、腰围、外生殖器等部位的色素痣，多属于交界痣。这些部位也容易受到各种摩擦刺激，恶变的可能性较大，生活中应加倍小心，认真呵护。
③混合痣则指痣细胞既长在表皮与真皮的交界处，也长在真皮下方。具有皮内痣与交界痣两者的特点。
但是上述三者用普通肉眼有时实在是无法区分的，只有作病理切片检查才能鉴别开来。
